L'importance des populations bactériennes dans les écosystèmes marins.
L'importance des populations bactériennes hétérotrophes
La mise en évidence du rôle des bactéries dans les océans et sa conceptualisation, qui leur accorde une place clef au sein de la boucle microbienne, souligne l'importance de ces organismes dans les principaux cycles biogéochimiques marins. Les bactéries hétérotrophes dominent les océans en termes d'abondance, de diversité et d'activité métabolique (Azam & Malfatti 2007). Elles sont les acteurs centraux des processus de minéralisation de la matière organique dissoute, et de sa transformation en biomasse utilisable par les maillons supérieurs de la chaîne trophique. La respiration des composés organiques est un processus majoritairement microbien (Pomeroy & Johannes 1968, Pomeroy 1974). Les bactéries hétérotrophes sont les seuls consommateurs de carbone organique dissous (à l'exception de quelques Flagellés). Proies principales des protistes bactérivores, les bactéries sont un maillon essentiel des transferts de carbone dans la boucle microbienne (Sherr & Sherr 1994). L'utilisation de la matière organique par les communautés de bactéries influe de façon conséquente les flux de carbone dans la colonne d'eau (Azam & Malfatti 2007).
L'importance des populations bactériennes autotrophes
Les bactéries autotrophes jouent aussi un rôle extrêmement important dans les cycles biogéochimiques marins, et en particulier dans celui du carbone. Bien que suggérée dès 1967 (Wauthy et al. 1967 , Jeffrey 1976 , Throndsen 1976), l'importance des bactéries photoautotrophes n'a commencé à être véritablement reconnue qu'après la découverte de Synechococcus, une cyanobactérie coccoïde mise en évidence à l'aide de la microscopie à épifluorescence (Waterbury et al. 1979). Dans les années 1980, l'expansion des techniques de cytométrie en flux a permis de révéler l'existence -puis l'importance- d'une autre cyanobactérie nommée Prochlorococcus (Chisholm et al. 1988 , Chisholm et al. 1992). Ces cyanobactéries sont particulièrement abondantes dans l'eau de mer. Les abondances moyennes de Synechococcus varient autour de 103 à 104 cellules.ml-1, celles de Prochlorococcus autour de 104 à 105 cellules.ml-1 (Not 2004). Ces fortes concentrations font de Prochlorococcus l'organisme photosynthétique le plus abondant de la biosphère (Partensky et al. 1999). Néanmoins, en termes de biomasse, la contribution des picophytoeucaryotes est plus importante que celle de ces deux genres de cyanobactéries (Li 1995).
Bibliographie
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